La ruta de serina es también cíclica, pero esta compuesta por un conjunto de reacciones completamente diferentes de las que corresponden a los ciclos de la ribulosa bifosfato y ribulosa monofosfato. La ruta de la serina realiza la asimilación tanto de formaldehido como de CO2 en la proporción aproximada de 2 a 1. Las unidades C derivadas del formaldehido son transferidas, después de su adicion al acido tetrahidrofolico (THF) y reducción, al aminoácido glicina, con formación de serina:

Metilen-THF +Glicina ------> THF+Serina

La serina se convierte después en acido fosfoglicerico, una parte del cual es asimilado y otra sirve para regenerar la glicina, el aceptor de C. El conjunto de reacciones por el que se regenera la glicina es complejo y requiere la asimilación de CO2 en el curso de la síntesis del intermediaro malato. La rotura de malil-CoA produce glioxilato y acetil-CoA. Las especies que poseen el enzima del ciclo del glioxilato convierten el acetil-CoA en glioxilato por la via del isocitrato.